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於 NCBI OMIM 中,分別三個 subfamily 個選取一個 (DNAJA1、DNAJB1、DNAJC1) 蛋白質序列,上傳至GCG作相似度比較

補充 : Similarity (大部分相同)、Identity (完全相同)

 

Local alignment (bestfit)

1. DNAJA1、DNAJB1 (Identity : 40.4%、 Similarity : 54.2%)

2  

 

2. DNAJA1、DNAJC1 (Identity : 45.2%、Similarity : 59.7%)

3  

 

Multiple Sequence Alignment (SDSC 網頁)

1. 將三條蛋白質序列進行比對,使用 SDSC 網頁中 Protein Tools 選項 CLUSTALW

4  

可得到結果如下 :

6

7   
5  

可以得知這三種 Subfamily 差異很大,Identity : 30%。

 

 

 

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    m0101223 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()